宏基因组
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类器官与常规组学服务
宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定生物环境中的整个微生物群落作为研究对象,采用新一代高通量测序技术,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等。具有通量高、速度快、信息全等特点,在鉴定低丰度的微生物群落、挖掘更多基因资源方面具有很大优势。
服务介绍
产品简介
宏基因组学(Metagenomics),也称元基因组学,利用新一代高通量测序技术(NGS)以特定环境下微生物群体基因组为研究对象,在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上,可进一步探究微生物群体功能特性、相互协作关系及与环境之间的关系,发掘潜在的生物学意义。此外,可以使用宏基因组拼接组装获得的contigs进行binning组装,并通过质量评估和筛选,获得高质量的bins,可以对指定的Bin进行基因组组装,并在基因组层面进行分析。与传统微生物研究方法相比,宏基因组测序技术规避了绝大部分。
分析内容

应用方向
医学研究:疾病与人体微生物间关系,如代谢类疾病、消化类疾病、自身免疫性疾病、肿瘤癌症、神经类疾病及其他疾病等;
畜牧研究:肠道、瘤胃等微生物与动物繁殖、生长发育、营养健康、免疫和疾病治疗等的互作关系;
农业研究:根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等;
环境研究:某一特定环境(雾霾、沙尘等污染环境,住宅、商场等生活环境)的微生物群落组成,有机肥发酵处理、污水治理、石油降解、水体及海洋等微生物群落分布和组成等。
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