重磅 | ChIP-qPCR太麻烦？看CUT&Tag如何弯道超车！
发布时间：2022-07-28
在表观遗传学中，传统的蛋白质-DNA互作研究技术ChIP和CUT&Tag在二代测序技术的加持下大放异彩，通过文库构建和丰富的生物信息学分析，能够在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的 DNA 区段。但整个实验流程费时费力，对于某些特定基因位点的检测，二代测序的成本较高，搭配速度快、成本低的qPCR是更明智的选择。
qPCR在关注特定基因和潜在调控区域的研究中具有成本低、实验限制少的优势，可应用于发育生物学，肿瘤机制研究以及组蛋白修饰对基因表达的影响等。但实现CUT&Tag-qPCR也并非易事，因为CUT&Tag的技术路线与ChIP有所不同，在ChIP实验中，被抗体特异性抓取的片段一般是目的基因片段，因此可以直接进行qPCR检测。而在传统的CUT&Tag实验流程中，是通过裂解细胞，回收全基因组，并扩增带有Tn5粘贴接头的DNA片段，达到对目的DNA片段进行文库构建的目的。因此，CUT&Tag兼容qPCR的关键点和难点在于回收的片段必须是被Tn5切割的目的片段。
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